upstream cvsにはmsパッチは入っている。debianではiconvのソースでjisxとかいじってるので、msパッチからどこを取り出すのか決めないといけない。だから誰かdpatch書かないとだめ。メンテナとしては優先度が低い。ので、誰か書いて。
doxygenが1.3になってからよくなってるな:いままでは1.2だったので。